Mikrocykly zohrávajú v praktickej organizácii tréningu rozhodujúcu úlohu. Sú najdôležitejšími etapami tréningu z hľadiska optimalizácie tréningového pôsobenia. Mikrocykly vychádzajú zo zamerania dlhších cyklov – mezocyklov a makrocyklov a svojou dĺžkou najviac vyhovujú operatívnemu riadeniu športovej prípravy.

Najčastejšie je dĺžka mikrocyklu 1 týždeň (od 2 do 10 dní). Dĺžka mikrocyklov závisí od obdobia a celkového zamerania tréningu. V prvej časti mikrocyklu nastáva naštartovanie adaptačných zmien, v druhej sa stabilizuje ich kvalita a v treťom je relatívny oddych, ktorý má zabezpečiť možnosť realizovať optimálne zaťaženie v ďalšom mikrocykle.

Štruktúru mikrocyklov ovplyvňuje:

* obsah jednotlivých tréningových jednotiek (druh zvolených podnetov),

* veľkosť zaťaženia v jednotlivých tréningových jednotkách (objem, intenzita, atď.),

* aktuálny stav trénovanosti športovca,

* individuálne osobitosti reakcií znáša zaťaženie a biorytmy,

* čas obnovy energetických rezerv medzi tréningovými jednotkami -pracovný režim športovca